医療を評価するための対象には、医療の構造・過程・結果があります。
病院機能評価では、医療の「構造」と「過程」（医療提供体制）のみを主体とするため、医療の「質」を直接評価するものではありません。
クリニカルインディケーターでは、医療または診療の「結果」を中心とした測定値を標準データと比較し、医療の質を向上することを目的としています。日本ではまだ研究段階であり、今後どの指標がクリニカルインディケーターとして有用であるか、標準データはどのように設定するのか等が話し合われている状態です。各病院単位で研究しても一定の効果は上がりますが、標準データを設定し比較対照するためには多くの医療機関のデータの蓄積が必要であり、大規模な研究体制が必要であるといえるでしょう。